Растительный мир республики многообразен и имеет большое народнохозяйственное значение. Растительность представлена основными типами, характерными для Большого Кавказа и Предкавказья: степная, лесостепная, лесная, нагорно-ксерофитная, субальпийская, альпийская, нитразональная.
Флора состоит из 4030 видов, в т.ч. водорослей - 300, лишайников - 250 , мхов - 122, сосудистых интродуцентов - 471, сосудистых аборигенных видов - 2437, грибов - 362 вида, культурных растений - 88. Преобладают такие семейства как астровые, лютиковые, мятниковые, яснотковые - типичные для Северной Евразии: встречаются ароидные, вербеновые, молочайные семейства, характерные для тропиков. Из наиболее крупных родов первенство принадлежит осокам, астрагалам, камнеломкам. Есть семейства, представленные 1-2 видами: тисовые, эфедровые, кизиловые.
Зарегистрировано около 100 видов дикорастущих сородичей культурных растений. Среди них 20 эндемичных, 15 из которых встречаются очень редко. При сокращении площадей дикорастущих плодовых, орехоплодных, ягодников, кормовых, медоносных трав и других происходит уничтожение и этих редких видов. Встречаются растения, присущие только данной местности. Редкие виды растений включены в Красные книги России и РСО-Алания.
В ассортименте лекарственных растений преобладают травы, которых насчитывается более 130 видов. Деревьев и кустарников в традиционной и народной медицине применяют более 50 пород, куда кроме аборигенных видов относится и интродуценты (шелковица, айва, сумах и др.). В республике имеется большая возможность для заготовки экологически чистого лекарственного сырья.